生物医学工程分属于工学和医学，是典型的交叉学科。事实上，一个专业名称对应两个专业代码的情况，通常发生在交叉学科。
交叉学科一览表(部分)
专业名称 | 可授学位类别 |
运动人体科学 | 教育学（04）、理学（07）、医学（10） |
科学技术史 | 理学（07）、工学（08）、农学（09）、医学（10） |
统计学 | 理学（07）、经济学（02） |
电子科学与技术类（包括物理电子学、电路与系统、微电子与固体物理学、电磁场与微波技术） | 工学（08）、理学（07） |
风景园林学 | 工学（08）、农学（09） |
医学技术 | 医学（10）、理学（07） |
管理科学与工程 | 管理学（12）、工学工学（08） |
社会医学与卫生事业管理 | 管理学（12）、医学（10） |
教育经济与管理 | 教育学（04）、管理学（12） |
基础医学 | 医学（10）、理学（07） |
生物医学工程 | 医学（10）、工学（08）、理学（07） |
心理学（包括基础心理学、应用心理学、发展与教育心理学） | 教育学（04）、理学（07） |
药学 | 理学（07）、医学（10） |
力学 | 理学（07）、工学（08） |
食品科学与工程 | 工学（08）、农学（09） |
计算机科学与技术 | 理学（07）、工学（08） |
材料科学与工程 | 理学（07）、工学（08） |
环境科学与工程 | 工学（08）、理学（07）、农学（09） |
公共卫生与预防医学 | 理学（07）、医学（10） |
中药学 | 理学（07）、医学（10） |
护理学 | 理学（07）、医学（10） |
设计学 | 艺术学（13）、工学（08） |
专业代码除了纯数字，偶尔还会“混”一些洋文，如吉林大学2013年的招生专业目录中法经济学的代码是0201J1。
代码中含字母的专业均为高校的自设专业。所谓自设专业，并不是高校想设置就可以设的，只有高校在某个一级学科上拿到博士点授权，才有资格申请自设特色专业，经过国家的严格审查批准后，才能招生。自设专业往往是该高校的传统特色专业或强势专业，只是在国家的学科专业目录中没有设置，才由高校自设。
如下表中吉林大学2013年硕士招生专业中学校自设专业都是吉大的优势专业;再如杭州师范大学的整体实力在全国虽不是很强，但是由于在中国法学界知名的法学家范忠信教授(享受国务院特殊津贴的学者，中国法律史协会执行会长)加盟该校，推动了其在法学领域的实力，该校也自设了法律文化专业(0301Z1)。
表2：吉林大学2013年硕士招生专业中学校自设专业目录
代码 | 专业 | 代码 | 专业 |
0501Z2 | 对外汉语教学 | 1203Z1 | 物流管理 |
1303L2 | 戏剧与影视学 | 0906Z1 | 兽医公共卫生 |
0201Z1 | 制度经济学 | 1007J1 | 再生医学 |
0201J1 | 法经济学 | 1007Z2 | 临床药学 |
1204Z1 | 公共治理与公共政策 | 0802Z2 | 工业工程 |
1204Z2 | 电子政务 | 0802Z1 | 车身工程 |
1201Z1 | 工程项目管理 | 0823Z1 | 物流工程 |
0702Z1 | 应用物理学 | 0828Z1 | 仿生科学与工程 |
0709Z1 | 数字地质科学 | 0818Z4 | 地下水科学与工程 |
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